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    金域医学
    背景图 2021-12-09 00:00:03

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    各街道社区核酸采样点排长龙,忙碌但有条不紊。

    照嗓子眼那么一捅,24小时后看手机就行了,核酸检测竟如此简单?

    今天我们就讲讲核酸检测如何做到如此快速且准确的。


    从喉咙到手机,

    你的核酸检测数据都经历了什么?

    被“捅”了那一下之后,你便完成了核酸检测的任务,而对于检测整体流程来说,一切才刚刚开始……

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    携带着细菌、病毒、上皮细胞的棉签样本被封存在试管中,并在第一时间送往检测中心,核酸提取工作便迅速展开!

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    检测中心的工作人员通过引物与核酸之间的反应获取检测结果,生成的检测结果会与你在排队时被扫码收集的个人信息通过人工搬运或拷贝等方式共同通过存储采集至医检机构总部数据中台。

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    如果把视角放得更宽,目前个别地区依然存在疫情复发风险,各街道、社区设立的医检分支的核酸数据采集就已经是极为庞大的工作量!

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    当核酸检测数据采集完毕至数据中台存储后,工作人员需要通过存储对新增的入库数据进行监控,并向数据中心推送数据新增清单,为下一步核酸检测数据分析做准备。

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    数据入库以后,工作人员会对不同区域的核酸检测数据进行分析。这个过程涉及对存储频繁的数据检索与调用,对检索效率有着极高的要求,检索要敏捷,分析要迅速。医检机构会将个人核酸检测报告发送给每个人,同时根据数据分析结果上报不同区域的疫情状态,对于疫情威胁采取相应措施。

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    注意到了吗?数据存储贯穿了核酸数据的采集、入库、分析的每一步,甚至可以说存储对数据的收集能力、快速推送能力、检索能力时刻影响着核酸检测流程的整体效率!


    深信服助力核酸医检“新速度”

    新冠疫情让更多人知道了新冠核酸检测,但对于承担检测工作的机构却了解甚少,事实上,除了各地疾控中心和医院检验科,第三方医学检测机构也是提供新冠检测服务的重要组成部分。


    从2020年初疫情爆发,到如今的抗疫常态化,各大医检机构一直扮演着“行者”的角色,从各街道、社区的海量的核酸采样、到快速检测、数据入库发布结果,医检工作人员通过无数个日夜的坚守,为人们提供快速便捷的服务,用一份又一份的核酸检测报告给市民送去安心。

    在核酸快速检测、强大的数据驾驭能力的背后,是深信服分布式存储EDS的支撑。深信服EDS通过构建生物信息数据管理系统,覆盖海量医检数据采集、治理、检索全流程,为某第三方医检机构的大数据平台提供底层存储能力支持。

    医检数据的自动化采集

    各医检分支机构数据采集流程安全可靠全自动化,从每日百GB的人工数据采集量提升到了“无穷大”,实现了RPA全自动化生物数据采集业务流程。

    某第三方医检分支机构通过使用EDS aDMT数据采集工具,将采集工具安装在医检设备服务器上,完成采集策略配置后,当医检数据在本地服务器生成,采集工具的探针会感知数据的生成,数据生成结束会自动通过https加密协议将医检数据自动采集到总部实验室的大数据对象存储资源池。


    深信服研发团队为了帮助分析师更好地完成数据采集,对aDMT在下载安装、策略配置、一键采集等环节都做好了防护策略,并通过断点续传、服务器重启aDMT自启动等手段来满足数据采集服务的长期稳定运行,而不会影响医学分析师的日常工作效率。


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    提升医检数据入库效率

    深信服EDS是一款遵循Low-code原则的智能化存储平台,可以根据用户约定的数据格式和API规范,完成数字化订阅。传统的数据入库是将非结构化数据通过采集、转换、装载,一条一条地插入到用户的数据库中,在这个过程中,需要监控新增的数据增量变化情况,通过编写监控脚本完成数据变化的监控,然后将新增的数据再通过编写脚本完成数据、元数据信息的数据库录入。

    采用EDS Low-code的数字化订阅服务,帮助医检中心的大数据分析师制定好API格式、字段后,EDS数字化订阅服务会根据用户的API字段将需要的数据信息提取出来,自动推送给大数据分析平台,平台接收到信号后会自动完成相关数据信息的数据库入库。


    相比传统方式,EDS帮助大数据分析节省了无效的编码工作,并且数据采集更加精确,根据实际统计EDS帮助该第三方医检机构提高了数据入库效率,日数据治理量从每日1万条提升到10万条,开发部门对数据入库和结构化的效率提高,整体业务流程更加顺畅高效。

    全面提升数据检索效率

    深信服EDS通过对象存储数据管理平台提供数据检索服务,面对上亿规模的医检非结构化数据,深信服利用自研Phxkv分布式数据库,降低元数据在I/O路径和资源等方面不必要的性能消耗与写入次数,提升整体性能,轻松承载百亿规模的元数据。


    在满足百亿级别元数据信息存储的同时,所消耗的空间仅占常用960GB SSD的50%,精准合理的元数据编排规划,能够帮助管理员日检索数据量从10条提升到“无穷条”,实现数据检索0等待。

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    后疫情时代,深信服分布式存储EDS深耕医检大数据数字化场景, 将智能化的统一存储能力以及便捷的数据管理服务帮助第三方医检机构构建医检大数据存储底座,携手提高医检大数据平台的建设效率,共同造福于民。

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